时孙策已尽得江东，闻曹操与袁绍相持于官渡，欲率军渡江北袭许昌。曹军皆惊，唯郭嘉说：“策新并江东，所诛皆英豪雄杰，能得人死力者也。然策轻而无备，虽有百万之众，无异于独行中原也。若刺客伏起，一人之敌耳。以吾观之，必死于匹夫之手”(《三国志·魏书·郭嘉传》)。后果为郭嘉言中。

　　建安五年(公元200年)四月，孙策又出去打猎。他骑的是上等精骏宝马，驰驱逐鹿，跟从的人绝对赶不上。正当他快如疾风地奔驰时，突然从草丛中跃出三人，弯弓搭箭，向他射来。孙策仓猝间，不及躲避，面颊中箭。这时，后面的扈从骑兵已经赶到，将三个人杀死。

　　原来，孙策曾杀死吴郡太守许贡。据《江表传》载，许贡上表给汉帝，说孙策骁勇，应该召回京师，控制使用，免生后患。此表被孙策的密探获得，孙策便责备许贡，并下令将其绞死。许贡死后，其门客潜藏在民间，寻机为他报仇，这次终于得手。

　　孙策中箭，创痛甚剧。自知不久于人世，便请来张昭等人，托以后事。他说：“中国方乱，夫以吴、越之众，三江之固，足以观成败。公等善相吾弟”(《三国志·吴书·孙讨逆传》)

　　接着，叫来孙权，给他佩上印绶，说：“举江东之众，决机于两阵之间，与天下争衡，卿不如我。举贤任能，各尽其心，以保江东，我不如卿”(《三国志·吴书·孙讨逆传》)

　　当天夜里，孙策去世，时年二十六岁。

　　关于孙策之死，众说纷纭。裴松之《三国志注》引《吴历》记载，孙策受伤，医生告诉他，说这伤可治，但应好好养护，一百天不能有剧烈活动。孙策拿过镜子自照面目，对左右说：“脸成了这个样子，还能建功立业吗?”奋起虎威，推几大吼，伤口都裂开了。当夜死去。《搜神记》则说孙策死于于吉为祟：孙策杀死于吉，此后，每一独坐，都感到于吉好像就在左右，心中恼火。这次调治箭伤刚有起色，引镜自照，又见于吉立在镜中，回头看，不见于吉，如是再三。孙策摔破镜子，奋力大吼，伤口崩裂而死。

　　《吴历》所记，可备一说；《搜神记》则纯是小说家造作虚幻之言。

　　孙权称帝后，追谥孙策为长沙桓王。

　　孙策英气杰济，猛锐冠世，览奇取异，志陵中夏。他仅用了几年时间，便开拓出会稽、吴郡、丹阳、豫章、庐江、庐陵六郡，招揽了大批人才，为日后东吴开国奠定了扎实的根基。确实是难得的人物。但他有时过于轻率武断，以致英年早逝，也真让人叹惋。