火影虽然是一部幻想型的漫画，但是当然漫画中也是存在科学性的东西的，不过实际上与其说是科学，到不如说是常识，而科学和常识是两个完全不同，却又有着一定的交集的概念。
　　常识，实际上指的就是工作学习，生活，包括科研等方便的一些基础知识，比如不可以用油去灭火；英文单词是由26个字母组合而成的；重力都是向下的；作用力和反作用力的大小是相等而方向相反的等等，这些东西都被称之为常识。
　　那么什么是科学呢？
　　科学在某种意义上来说就是用来解释常识或者某些现象背后的原理、原因的学问，比如流星进入大气层之后会出现长长的闪亮轨迹，彗星的尾巴老是背对着太阳的，这些都是现象，而被广为人知的现象就可以称之为常识，用来客观的、合理的解释“流星出现闪亮尾迹”“彗星的尾巴总是背对太阳”的原因的方法，就是科学。
　　所以说与其说火影中存在科学，不如说是存在常识，当然了，本身漫画作品要容易被人接受的话，建立在常识性的东西上来阐述作品当然是不可避免的，如果一部作品不具有现实中存在的任何常识和现象的话，这个作品是不可能产生的，因为这种跟现实生活完全的脱节的作品真的是想象不能。

　　火影当然也是建立在一定的常识上发展出来的漫画，所有出现具有符合科学理论的常识现象，这也没有什么值得奇怪的，也不可能漫画中没有可以用科学道理解释的常识存在这个情况，或多或少的任何作品中都是存在可以用科学道理解释的地方的。
　　当然也实际上有着这麽做过，将火影中的力学、物理学现象，套用现实中的物理学来进行解释，但是却无法解释因为查克拉的原因所产生的力学或者物理学现象。但是其实我想说的是，如果确实是物理学现象的话，哪怕是牵扯到查克拉的存在，也是可以用现实中的物理学来解释的。
　　如果真的是物理学现象，那么不管牵扯到什么样的未知能量，都是具有科学的解释的，但是我要声明一点，我并不是说可以用科学道理解释火影中的一切现象，比如拥有九尾的查克拉外衣的鸣人拥有者连铁都可以抓碎的身体硬度，却轻易地被佐助的刀给刺穿了。
　　我说过『用科学的观点来解释火影本身就是一件不科学的事情』，因为虽然单个的现象也许是具有科学道理的，但是如果与这单个现象相关联的其他现象，统一起来之后无法用科学道理解释的话，那么这种解释本身就是不科学的，只是一种浪费时间的行为。
　　比如佐助与雷影的战斗中由于两个人的雷遁的冲突所产生的大坑。