忍者会馆系统，是一个让玩家能够通过抽卡获得忍者的地方。卡卡西说，运气是实力的一部分。你何不来此尝试一下？
　　玩家只要完成5级的主线任务之后就可以开启忍者会馆，忍者会馆的卡片品质从低到高分为优秀，精良，完美，经典，忍者相对应的卡片品质越高，忍者的属性也就会越强大。　　
　　
　　在忍者会馆的界面上可以看到三个板块，分别为初涉忍界，忍界精英和忍界巅峰，每一个板块所涉及的卡片品质也都不同。初涉忍界的卡片品质为优秀，精良，完美。忍界精英的卡片品质为精良，完美，经典。而忍界巅峰的卡片品质只涉及完美和经典。但是按照概率来说，每个版块的卡片获得的概率都是品质越高，抽到的几率也就越低。抽出的忍者卡片你可以选择直接招募忍者或者保存卡片当成伙伴进阶的材料。
　　忍者会馆有三个抽卡版块，但是各个版块的抽卡机会和要求也各不相同。
　　初涉忍界：每天有5次银币抽卡机会，每次抽卡相隔10分钟CD，每次需要银币50万。
　　忍界精英：每间隔24小时会有一次银币抽卡机会，每次需要银币500万。
　　忍界巅峰：每间隔72小时获得一次银币抽卡机会，每次需要银币1500万。
　　当然，在银币抽卡CD期间你也可以花费相应的金币进行抽卡，金币抽卡无CD。
　　另外，幸运值也是忍者会馆系统中一个重要的组成部分，使用金币抽卡可以获得该幸运值，幸运值累积可以获得不同品质的奖励。