忍者会馆系统在完成5级主线任务后开放，是一种新增的伙伴招募途径。玩家可以通过点击屏幕右上方的会馆按钮来打开相关界面，通过这一方式获得的忍者还可以存为卡片，用以在“伙伴”中提升主力忍者的星阶（具体查看游戏资料“伙伴进阶”）。

　　【玩法介绍】
　　在忍者会馆的界面上可以看到三个板块，分别为初涉忍界，忍界精英和忍界巅峰，每一个板块可以抽到的卡片品质也都不同。初涉忍界的卡片品质为优秀，精良，完美。忍界精英的卡片品质为精良，完美，经典。而忍界巅峰的卡片品质只涉及完美和经典。但是按照概率来说，每个版块的卡片获得的概率都是品质越高，抽到的几率也就越低。抽出的忍者卡片你可以选择直接招募忍者或者保存卡片当成伙伴进阶的材料。

　　【抽卡机会】
　　忍者会馆有三个抽卡版块，但是各个版块的抽卡机会和要求也各不相同。
　　初涉忍界：每天有5次银币抽卡机会，每次抽卡相隔10分钟CD，每次需要银币50万。
　　忍界精英：每间隔24小时会有一次银币抽卡机会，每次需要银币500万。
　　忍界巅峰：每间隔72小时获得一次免费抽卡机会，无需消耗银币或者金币。
　　当然，在银币抽卡CD期间，玩家也可以花费相应的金币进行抽卡，金币抽卡不但没有CD限制，还会有幸运值累计，幸运值达到一定程度就可以兑换卡片。
　　【幸运值】
　　幸运值是忍者会馆系统中一个重要的组成部分，每一次使用金币抽卡都可以获得幸运值，VIP级别越高的玩家获得幸运值就越多，幸运值累积可以领取不同品质的奖励：
　　500点幸运值可随机获取优秀品质忍者卡片。
　　1500点幸运值可随机获取精良品质忍者卡片。
　　4000点幸运值可随机获取完美品质忍者卡片。
　　6000点幸运值可随机获取经典品质忍者卡片。